群体遗传与分子进化  061M4020H

学期:2017—2018学年(春)第二学期 | 课程属性:专业核心课 | 任课教师:桑涛,吕雪梅,钱文峰,张勇,陈华
授课时间: 星期一, 第5、6、7节
授课地点: 教2-107
授课周次: 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16
授课时间: 星期一, 第5、6、7节
授课地点: 教2-107
授课周次: 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16
课程编号: 061M4020H 课时: 60 学分: 4.0
课程属性: 专业核心课 主讲教师:桑涛,吕雪梅,钱文峰,张勇,陈华
英文名称: Population genetics and molecular evolution

教学目的、要求

帮助学生理解群体遗传学的基本理论以及进化的分子和发育生物学基础,从而利用分子进化和群体遗传的方法更有效地研究生物多样性的形成和变迁、自然和人工选择、农作物育种和改良、疾病的遗传基础以及基因组进化。本课程要求学生积极阅读相关文献、主动参与课堂讨论,尽可能将课程内容与自己的研究兴趣结合起来,认真思考科学问题,努力做到学以致用。

预修课程

遗传学、分子生物学

教 材

主要内容

内容提要: 
前言 (3学时,教师:桑涛;授课时间2018年3月5日)
1、进化生物学概述
1.1 进化生物学发展历史
1.2进化在生命科学研究中的作用和应用

第一部分:群体遗传学简介(6学时,教师:桑涛;授课时间:3月12日、3月19日)
2、群体遗传学的基本理论和方法
2.1群体遗传学的兴起和发展
2.2哈温平衡
2.3选择和漂变
3、群体遗传学的进展和应用
3.1分子证据
3.2 基因组证据
3.3 人工选择和农业

第二部分:遗传多样性和自然选择(9学时,教师:陈华;授课时间:3月26日、4月2日、4月9日)
4、利用遗传多态推断群体历史
4.1遗传多态性,基因谱系与溯祖过程
4.2 溯祖理论模型和群体遗传学推断
4.3 利用基因组遗传多态推断群体历史
5、自然选择的检测
5.1 自然选择的类型
5.2 自然选择对遗传多态性的作用
5.3自然选择的常用检测方法
5.4 现代人群中著名的自然选择例子

第三部分:变异的起源和进化发育(9学时,教师:张勇;授课时间:4月16、
4月23日、4月30日)
6、变异的起源
6.1小突变、大突变
6.2突变的速率和属性
6.3 非典型突变
7、进化发育 (Evo-Devo)
7.1 Sean B. Carroll眼下的Evo-Devo
7.2 Douglas J. Futuyma教科书中的Evo-Devo
8、基因内容的演化
8.1 突变与新基因产生
8.2 突变与基因丢失
8.3 Evo-Devo中的基因内容演化

半期考试(3学时,教师:桑涛、陈华、张勇;助教:李春燕;时间:5月7日)

第四部分:生物进化与社会(9学时,教师:钱文峰;授课时间:5月14日、5月21日、5月28日)
9、数量遗传学与进化
9.1狭义遗传率
9.2广义遗传率
9.3连锁分析
9.4关联分析
10、生物进化与社会
10.1近交系数与社会
10.2自然选择与社会
10.3中性漂变与社会
11、性选择
11.1有性生殖和异配生殖的进化
11.2性选择
11.3性冲突

第五部分:物种形成及细胞水平的演化(9学时,教师:吕雪梅;授课时间:6月4日、6月11日、6月18日)(6月18日的课程将涉及端午假期调课)
12、物种形成
12.1物种形成的基本理论
12.2物种形成的经典遗传学研究
12.3 物种形成的基因组学基础
13、细胞水平的演化(肿瘤演化和细胞实验进化)
13.1肿瘤研究的发展历史与问题
13.2细胞水平的实验进化
13.3肿瘤异质性和演化

第六部分:讨论 I(3学时,教师:陈华、张勇;时间:6月25日)
讨论 II(3学时;教师:钱文峰、吕雪梅;时间:7月2日)

总结(3学时;教师:桑涛;时间:7月9日)

期末考试(3学时;教师:吕雪梅、钱文峰;助教:李春燕;时间:7月16日)

教学方式:75 % 课堂授课 + 25 % 文献阅读和讨论
考核方式:闭卷考试(期中36%,期末24%),课堂讨论(25%),平时(15%)

参考文献

参考书:
1.	Principals of population genetics, Fourth Edition. Daniel Hartl/Andrew Clark 2007.
2.	Gene Genealogies, Variation and Evolution: A Primer in Coalescent Theory. Jotun Hein and Mikkel Schierup 2004.
3.	Evolution,Third Edition,Douglas J. Futuyma 2013.